Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms