Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L4Q8WXT5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms