Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCOLN3Q8TDD5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms