Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms