Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms