Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP1Q86WV1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms