Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms