Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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