Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms