Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms