Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms