Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms