Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms