Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF123Q5XPI4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms