Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms