Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms