Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms