Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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