Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms