Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms