Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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