Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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