Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PCK2Q16822 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCK2Q16822 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCK2Q16822 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCK2Q16822 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCK2Q16822 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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