Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms