Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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