Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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GABRA6Q16445 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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