Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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