Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms