Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms