Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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VPS72Q15906 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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VPS72Q15906 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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VPS72Q15906 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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VPS72Q15906 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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