Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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