Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms