Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms