Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms