Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABEP1Q15276 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms