Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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