Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EEA1Q15075 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms