Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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