Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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