Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CAPSQ13938 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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