Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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NCOA4Q13772 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NCOA4Q13772 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NCOA4Q13772 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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