Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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