Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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