Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC1Q13547 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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