Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms