Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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CALCOCO2Q13137 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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