Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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