Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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