Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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