Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRJQ12913 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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